Действие игры происходит после третьего сезона аниме.
- В Академию Сэйё посередине учебного года поступили два новых ученика - брат и сестра из богатой семьи. Загадочные и элегантные, они держутся в стороне от других учеников. Чары чувствуют в них что-то необычное и подозревают, что это их враги. Кто же они на самом деле?!
- Всё больше чар заболевают каким-то новым вирусом. Они неспособны преображать своего хранителя и постепенно превращаются в икс-чар. По этому поводу команда защитников собирает своих друзей: Лулу, Икуто, Кайри и многих других!
- После того, как Пасха распалась бумаги этой организации попали в руки одной влиятельной фирмы. В этих бумагах описывался Эмбрион, чары, хранители и прочее. Теперь хозяйка фирмы жаждет узнать больше о мире чар и сама заполучить себе несколько яиц сердец.